Pneumocystis jiroveci DNA/RNA


	1)	Indikation
	2)	Rekvisition
	3)	Prøvemateriale
	4)	Prøvemedie/prøvetagning
	5)	Transport/holdbarhed
	6)	Svartid
	7)	Analyse
	8)	Analysesvar samt tolkning
	9)	Princip for analysen
	10)	Konfirmation
	11)	Vejledning/rådgivning
	12)	Sensitivitet/specificitet
	13)	Kvalitetskontrol
	14)	Måleområde
	15)	CE mærkning/akkreditering
	16)	Andre oplysninger
	17)	Baggrund
	18)	Litteratur

1)	Indikation Analysen anbefales ved mistanke om infektion med Pneumocystis jiroveci.

2)	Rekvisition WebReq: Udbydes ikke til almen praksis Best/Ord: 22070 Undersøgelse: Pneumocystis jiroveci DNA/RNA Materiale: BAL, mundskyllevæske, trakealsekret Lokalisation: .

3)	Prøvemateriale Bronchoalveolær lavage (BAL), trakealsekret eller mundskyllevand.

4)	Prøvemedie/prøvetagning Mindst 1 ml BAL fremsendes i sterilt spidsglas Munden skylles i ca. 10 ml isotont saltvand i ca. 1 minut – fremsendes i sterilt spidsglas.

5)	Transport/holdbarhed Prøven skal transporteres til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling umiddelbart efter prøvetagning og skal være modtaget senest 3 døgn efter prøvetagning. Inden transport opbevares prøve ved 4° C.

6)	Svartid Analysen udføres alle dage. Gennemsnitlig svartid fra modtagelse: under 24 timer

7)	Analyse Pneumocystis jiroveci DNA PCR.

8)	Analysesvar samt tolkning Positiv: Pneumocystis jiroveci DNA påvist Negativ: Pneumocystis jiroveci DNA ikke påvist

Princip for analysen

Realtime Nukleinsyre Amplifikation (Polymerase kæde reaktion, PCR) på Taqman platform. Analysen er rettet mod både MSG og UCS generne. Opformerede PCR produkter identificeres ved hybridisering til genspecifikke Pneumocystis jiroveci prober der er mærket med individuelle fluorophorer.

10)	Konfirmation Analysen er internt konfirmeret idet kliniske prøver der indeholder Pneumocystis jiroveci forventes at give et positivt resultat for både MSG og UCS generne.

11)	Vejledning/rådgivning Vagthavende på klinisk mikrobiologisk afdeling: 3862 6443

12)	Sensitivitet/specificitet Sensitivitet: 5 kopier (specifikt Pneumocystis jiroveci gen klonet i plasmid) pr. analyse Specificitet: Analysen detekterer ikke andre mikroorganismer

13)

Kvalitetskontrol

Intern QC: Negative kontroller, samt positive Pneumocystis jiroveci kontroller inkluderes i hver analysekørsel. Analysekomponenterne er fremstillet under kontrollerede betingelser. Kontrol virus tilsættes hver prøve for at monitorere prøveekstraktion samt amplifikation

Ekstern QC: Ikke tilgængelig

14)	Måleområde Analysen besvares kvalitativt.

15)	CE mærkning/akkreditering Nej

16)	Andre oplysninger

17)	Baggrund Pneumocysti jiroveci forårsager opportunistiske infektioner i de nedre luftveje hos personer med et kompromitteret immunforsvar. Hos børn (ca. 1 år) kan primær infektion være associeret med et billede af øvre luftvejsinfektion.

18)	Litteratur HH Larsen, ML von Linstow, B Lundgren, B Høgh, H Westh, JD Lundgren. Primary pneumocystis infection in infants hospitalized with acute respiratory tract infection. Emerg Infect Dis 2007; 13:66-72 Hans Henrik Larsen et al, Journal of Infectious Diseases 2004; 189: 1679-83

11.10.2022