Luftvejsvirus (udvidet) DNA/RNA


	1)	Indikation
	2)	Rekvisition
	3)	Prøvemateriale
	4)	Prøvemedie/prøvetagning
	5)	Transport/holdbarhed
	6)	Svartid
	7)	Analyse
	8)	Analysesvar samt tolkning
	9)	Princip for analysen
	10)	Konfirmation
	11)	Vejledning/rådgivning
	12)	Sensitivitet/specificitet
	13)	Kvalitetskontrol
	14)	Måleområde
	15)	CE mærkning/akkreditering
	16)	Andre oplysninger
	17)	Baggrund
	18)	Litteratur

1)	Indikation Ved Luftvejsvirus (udvidet) undersøges for adenovirus (AdV), human metapneumovirus (hMPV), parainfluenzavirus 1-4 (PIV 1-4) og rhinovirus (RV). Ved behov for undersøgelse for Influenza A+B og RS Virus DNA/RNA, bestilles denne særskilt på Best/Ord: 52050.

2)	Rekvisition WebReq: Udbydes ikke til praksis. Best/Ord: 33057 Undersøgelse: Luftvejsvirus (udvidet) DNA/RNA Materiale: Nasopharynxsekret, trakealsekret, BAL, ekspektorat, podning Lokalisation: . Lokalisation podning: Svælg, næsesvælgrum (nasopharynx)

3)	Prøvemateriale Nasopharyngealt sug, ekspektorat, trakealsekret, podning fra nasopharynx eller svælgpodning. Ved mistanke om viral lungeinfektion bør dybt luftvejssekret fremsendes evt. suppleret med nasopharynxsekret.

4)	Prøvemedie/prøvetagning Materiale fra luftveje fremsendes i sterilt spidsglas. Podning fra nasopharynx eller svælg sendes i Aptima Multitest Swab.

5)	Transport/holdbarhed Prøven skal transporteres til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling umiddelbart efter prøvetagning og skal være modtaget senest 3 døgn efter prøvetagning. Inden transport opbevares prøve ved 4° C.

6)	Svartid Analysen udføres alle ugens dage. Prøven kan, under normale omstændigheder, forventes besvaret senest dagen efter modtagelse på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling.

7)	Analyse Adenovirus, human metapneumovirus (hMPV), parainfluenzavirus 1-4 (PIV1-4) og rhinovirus.

8)	Analysesvar samt tolkning Positiv: Adenovirus, human metapneumovirus (hMPV), parainfluenzavirus 1-4 (PIV1-4) og/eller rhinovirus DNA/RNA påvist. Negativ: Adenovirus, human metapneumovirus (hMPV), parainfluenzavirus 1-4 (PIV1-4) og rhinovirus DNA/RNA ikke påvist.

Princip for analysen

Analysen udføres med et kommercielt kit fra Hologic, der køres på Panther fusion systemet. Der benyttes Real-Time PCR til at amplificere et specifikt område af et genom, ved brug af en DNA polymerase. Herved genereres et eksponentielt stigende antal DNA kopier af patogen-specifik nukleotidsekvens. Til detektion benyttes en fluorescerende probe, der udsender lys, såfremt prøven indeholder probespecifikt DNA.

10)	Konfirmation Analysen konfirmeres ikke.

11)	Vejledning/rådgivning Vagthavende mikrobiolog hospital tlf. 3862 6443.

12)	Sensitivitet/specificitet TCID₅₀/ml fra 110^-2 – 110² (se evt. package inserts for AdV/hMPV/RV Assay og Paraflu Assay, Panther Fusion System)

13)	Kvalitetskontrol Intern QC: Negative kontroller, samt positive kontroller for hvert target inkluderes i hver analysekørsel. Ekstern QC: Analysen indgår i Laboratoriets program for ekstern kvalitetskontrol (QCMD, DEKS).

14)	Måleområde Ikke relevant

15)	CE mærkning/akkreditering Analysen er CE mærket

16)	Andre oplysninger Ikke relevant

17)

Baggrund

Human metapneumovirus:

Forårsager RSV-lignende luftvejsinfektioner. Den præcise prevalens kendes ikke, men forskellige studier synes at vise, at hMPV forekommer hos 5 - 15 % af børn med luftvejsinfektioner i vinterhalvåret.
Co-infektion med RSV forekommer.

Rhinovirus:

Hyppig årsag til almindelig forkølelse. Hos patienter med kroniske lungesygdomme (astma, KOL) kan virus ofte påvises i relation til akut anfald/exacerbation. Den patogenetiske betydning heraf er uafklaret.

Adenovirus:

Kan forårsage nedre luftvejsinfektion, pharyngitis, konjunktivitis og gastroenteritis. Der findes mindst 51 humanpatogene Adenovirus serotyper, der inddeles i seks grupper (A-F). Gruppe B og E forårsager nedre luftvejsinfektioner. De fleste serotyper giver kun sjældent anledning til sygdomme. Hos immundefekte ses såvel pneumoni som hepatitis.

Parainfluenzavirus:

Forårsager nedre luftvejsinfektioner, især hos børn under 5 år. Hos voksne forårsager virus subkliniske infektioner eller et mildt influenzalignende sygdomsbillede.

18)	Litteratur Panther Fusion vejledning fra Hologic Hologic Package inserts for Adv/hMPV/RV og Paraflu

30.09.2024