Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) / Influenza A & B DNA/RNA

Analysen anbefales, hvis der ønskes undersøgelse for Coronavirus (SARS-CoV-2) og Influenzavirus type A og B.

WebReq: Coronavirus SARS-CoV-2 og Influenza virus A+B DNA/RNA 

Best/Ord: 52055

Undersøgelse: Coronavirus SARS-CoV-2 / Influenza A+B DNA/RNA

Materiale: Ekspektorat, trakealsekret, BAL, nasopharynxsekret, podning

Lokalisation (podning): Svælg, næsesvælgrum (nasopharynx)

Er prøven bestilt korrekt, kan det ses i SP, når KMA445 har modtaget og registreret prøven.

Ekspektorat, nasopharyngealt sug/trakealsekret/BAL/podning fra svælg eller næsesvælgrum. Ved mistanke om viral lungeinfektion bør dybt luftvejssekret fremsendes evt. suppleret med nasopharynxsekret.

Materiale fra luftveje fremsendes i sterilt spidsglas.

Podning fra svælg eller næsesvælgrum tages med følgende rør:

Aptima Multitest rør (orange label og hvidt låg) 

For eventuelle erstatningsrør - se den senest opdaterede utensilieoversigt

Podning fra næse-svælgrum (nasopharynx):

Podepind føres langs bunden af næsehulen i en længde på ca. 7 cm hos en voksen således, at den berører bagvæggen af nasopharynx. Pres podepinden mod siden og rotér to gange. Placer podepinden i røret, knæk pinden langs kanten af røret og skru låget grundigt på.

Podning fra svælget:

Podepind indføres i den bageste del af pharynx (bag ganebåndet). Herefter presses podepinden mod slimhinden langs bagsiden af tonsil-lejet og føres op og ned 2 gange. Placer podepinden i røret, knæk pinden langs kanten af røret og skru låget på.

Gennemsnitlig svartid er seks timer efter ankomst til Klinisk Mikrobiologisk afdeling. Der kan forventes svar senest dagen efter prøven er ankommet til afdelingen. 

SARS-CoV-2 RNA og Influenzavirus A og B RNA påvises med kommercielt assay fra Hologic til brug på Panther System.

Positiv: 

Negativ: 

Det kommercielle kit AptimaTM SARS-CoV-2/Flu Assay (PantherTM System) er en multiplex analyse der kan påvise SARS-CoV-2, Influenza A og Influenza B. Analysen benytter Real-time TMA (isotermisk amplifikation) til at påvise SARS-CoV-2 (2 områder i ORF1ab genet), Influenza A (1 område i matrix genet) og Influenza B (1 område i matrix genet). TMA-analysemetoden er kvalitativ, med en dikotomisk svarafgivelse (påvist/ikke påvist).

Udvalgte positive Corona prøver sendes til fuldgenom sekventering for overvågning og udvalgte positive Influenza A prøver sendes til subtypning (H1N1 og H3N2).

Nedre detektions grænser (≥ 95% er angivet i tabellen nedenfor).

(Se evt. Package inserts for Aptima SARS-CoV-2/FLU Assay).

Intern QC: Der indgår en Intern Control (IC) i analysen der dækker over SARS-CoV-2, Influenza A og Influenza B.

Ekstern QC:

Analysen indgår i laboratoriets program for ekstern kvalitetskontrol QCMD (Quality Control of Microbiology Diagnostics).

Podninger, som testes negative, kasseres efter udsvar af resultatet.

Dybe luftvejssekreter (trakealsekret, ekspektorat og BAL) gemmes i en uge uanset om de er positive eller negative.

Coronavirus (SARS-CoV-2):

SARS-CoV-2 er et corona virus, der forårsager sygdommen COVID-19. Virus blev første gang identificeret i Wuhan, Kina i december 2019. I marts 2020 erklærede WHO sygdommen for en pandemi og per februar 2021 er mere end to millioner døde på verdensplan. Sygdomsspektret spænder vidt fra milde øvre luftvejsinfektioner til tilfælde med alvorlige pneumonier med respirationssvigt, multiorgansvigt og døden til følge. 

Diagnostikken baseres på PCR-test med detektion af virus RNA.

Influenzavirus:
Influenza skyldes influenzavirus A eller B. Symptomdebut med pludselig indsættende højfebrilia, kulderystelser, muskelsmerter, hovedpine og ofte forkølelsessymptomer. Der kan ses alvorlige komplikationer, hvor en sekundær bakteriel pneumoni – ofte forårsaget af Staphylococcus aureus – er den hyppigste.